Sexta por orden de nacimiento, la princesa María fue la primera hija del príncipe regente Fernando y su esposa Leonor de Alburquerque, quienes la destinaron desde el mismo momento de nacer para ser la esposa de su primo carnal, el futuro Juan II de Castilla.

 La muerte de la reina-madre Catalina de Lancáster (1418) , dos años después que la del príncipe-regente Fernando, obligó a establecer en Castilla un Consejo de regencia que recayó en el joven infante don Juan (18 años), que contaba con el total apoyo de Sancho de Rojas, antiguo privado de su padre.

 Encumbrado por Fernando de Trastámara al arzobispado de Toledo, Sancho de Rojas aprovechó la situación para consolidar el matrimonio del futuro monarca castellano (13 años) con su prima María de Aragón. La boda se celebró en Medina del Campo, el 20 de octubre de aquel mismo año, cuatro meses antes que el príncipe heredero fuera proclamado mayor de edad ante las Cortes castellanas, reunidas el 7 de marzo de 1419, en Madrid.

 De esta unión, nacería un solo hijo, el futuro Enrique IV el Impotente

La reina María, en lugar de mantenerse al margen de las guerras civiles provocadas por sus hermanos para derrotar a don Álvaro de Luna, favorito de su marido, tomó parte activa en ellas . En 1440, firmó con su hermano el infante Juan, entonces rey consorte de Navarra, un pacto de confederación contra el valido, que supuso el primer destierro de don Álvaro.